柳澤研究室

About关于研究室

先端の計算技術で、創薬の問題を解く。

柳澤研究室は、スーパーコンピュータや量子アニーラなど最先端の計算機システムを使って、生命現象の解明や創薬への応用を目指しています。
大規模なシミュレーションからアルゴリズムの設計まで、幅広い方策を武器にしています。
計算科学の手法による創薬支援、シミュレーションに基づく解析手法の開発、量子アニーリングの創薬研究への応用に取り組んでいます。

Research研究课题

スーパーコンピュータや量子アニーラなど最先端の計算機システムを駆使し、複雑な生命現象の解明や創薬分野への応用を目指しています。大規模シミュレーションからアルゴリズム設計まで、幅広い方策を武器にしています。

※示意图

バーチャルスクリーニング↗

大きな化合物ライブラリから、有望な薬の候補を計算機で選抜する手法です。化合物に共通する部分構造（フラグメント）に着目し、計算結果を再利用することで、計算量を大きく減らします。

※示意图

分子動力学シミュレーション↗

原子・分子の動きを物理法則に基づいて計算し、生体分子のふるまいを全原子のレベルで解析します。プローブ分子を水に混ぜた共溶媒MD法による相互作用の解析や、環状ペプチドの膜透過性の予測に取り組んでいます。

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量子アニーリング↗

組合せ最適化の問題をQUBOという形に書き直すと、量子アニーリングの技術が使えます。創薬に現れる組合せ最適化の問題を、量子アニーラで効率よく解く新しいアプローチを研究しています。

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