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生物信息工学研究室
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利用计算机阐明蛋白质发挥功能机制的研究室。
About关于研究室
用计算机理解蛋白质。
生物信息工学研究室利用计算机研究蛋白质发挥功能的机制。
该研究室使用生物信息学、
研究课题包括酶推进反应机制的计算、
该研究室还积极与做实验的研究者开展合作研究。
术语说明
- 量子化学计算
- 基于量子力学计算电子的行为，
研究分子性质和化学反应发生方式的方法 - 分子动力学模拟
- 计算作用于原子和分
子的力， 在计算机中按时间顺序再现其运动的方法 - 粗粒化
- 将若干原子合并为一个粒子来处理，
以减 轻计算量， 从而能够处理更大的体系和更长时间尺度的做法
News研究室公告
博士课程的学生在第26届日本蛋白质科学会年会上获得海报奖
学生在第5届生物分子模拟・建模研究会上获得学生优秀报告奖
博士课程的学生在第63届日本生物物理学会年会上获得学生报告奖
博士课程的学生在第38届分子模拟讨论会上获得学生优秀报告奖
Research研究课题
运用计算机开展阐明蛋白质发挥功能机制的研究。
※示意图通过量子化学计算观察酶反应
利用量子化学计算研究酶推进化学反应的机制。
※示意图通过模拟观察蛋白质
利用分子动力学模拟研究蛋白质发挥功能的机制。
※示意图粗粒化模拟的开发
以用
※示意图用机器学习预测蛋白质功能
利用机器学习等方法，
Members教师
生物信息工学研究室的成员由教师、
Voices学长学姐的评价
根据所属学生的回答整理。
对于接受采访的学生，
4级评分中，
推荐给什么样的学生?
这个研究室的推荐点是什么?
进入后才知道的事情是什么?
氛围和老师的性格如何?
毕业后的去向?
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关于图片
顶部和研究课题的图片为示意图，
- 顶部图片：《Dynamic simulation screenshot》 Jih24／CC BY-SA 4.0（裁剪）
- 通过量子化学计算观察酶反应：《Active site of human ACE2》 ChemPro／CC0（裁剪）
- 通过模拟观察蛋白质：《7CN1 viewed from outside》 Asai, T.,Adachi, N.,Moriya, T.,Kawasaki, M.,Suzuki, K.,Senda, T.,Murata, T.／CC0（裁剪）
- 粗粒化模拟的开发：《All atom vs coarse grain DPPC bilayer》 Christopher Rowley／CC0（裁剪）
- 用机器学习预测蛋白质功能：《TMEM253 AlphaFold Predicted Structure》 Liu02511／CC0（裁剪）
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（生命信息分析研究室） ：《Heatmap》 Miguel Andrade at English Wikipedia／公有领域 （裁剪） - 相关研究室
（细胞功能工学研究室） ：《Streptomyces hygroscopicus》 Snuupo／CC BY-SA 4.0（裁剪） - 相关研究室
（植物功能工学研究室） ：《Arabidopsis thaliana sl13》 Stefan.lefnaer／CC BY-SA 4.0（裁剪）
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