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九州大学 生体防御医学研究所 共同研究部門の研究室

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高深度オミクス解析部門

伊藤 由馬

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組織の中でどの細胞が何を発現しているかを捉える技術を開発する部門。

生体防御医学研究所の高深度オミクス解析共同研究部門は、どの細胞が組織のどこに位置し、何を発現しているかを同時に捉える空間オミクスの技術を開発しています。細胞に位置情報を分子バーコードとして書き込む技術と、一細胞レベルの遺伝子発現解析を組み合わせ、組織を単一細胞の空間地図として再構築する手法に取り組んでいます。細胞の正常な働きを乱すRNAが細胞内のどこで働くのかを、RNAとタンパク質の化学的変化を細胞内で同時に可視化し、AI画像解析で調べる技術も開発しています。

#空間オミクス #腫瘍微小環境 #一細胞解析

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ネットワークAI統計解析部門

藤田 アンドレ

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グラフのスペクトルでネットワークを統計的に調べる研究部門。

ネットワークAI統計解析共同研究部門は、生体防御医学研究所の共同研究部門です。藤田アンドレ教授が最終著者を務めた論文では、グラフのスペクトルを使って大きなネットワークを効率よく調べる方法や、向きのあるネットワークを統計的に調べる方法を扱っています。ネットワークの比較やクラスタリングなどの統計解析をまとめた R のパッケージ statGraph も、論文で紹介されています。脳の機能的結合や遺伝子発現のデータをネットワークの考え方で調べた論文には、藤田教授が共著者として加わっています。

#ネットワーク統計 #グラフのスペクトル #計算統計学

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