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生物情報工学研究室
コンピュータでタンパク質がはたらくしくみを解き明かす研究室。

About研究室について
コンピュータでタンパク質を理解する。
生物情報工学研究室は、
バイオインフォマティクスや
酵素が
実験を
用語の説明
- 量子化学計算
- 電子の
ふる まいを 量子力学にもと づいて 計算し、 分子の 性質や 化学反応の 起こり方を 調べる 方法 - 分
子動力学シミュレーション - 原子や
分子には たらく 力を 計算し、 その 動きを コンピュータの 中で 時間を 追って 再現する 方法 - 粗視化
- いく
つかの 原子を ひとつの 粒に まとめて 扱い、 計算を 軽くして 大きな 系や 長い 時間を 扱えるように する 工夫
News研究室のお知らせ
博士課程の
学生が、 第26回日本蛋白質科学会年会で ポスター賞を 受賞 学生が、
第5回生体分子シミュレーション・モデリング研究会で 学生優秀発表賞を 受賞 博士課程の
学生が、 第63回日本生物物理学会年会で 学生発表賞を 受賞 博士課程の
学生が、 第38回分子シミュレーション討論会で 学生優秀発表賞を 受賞
Research研究テーマ
コンピュータを
※イメージ画像量子化学計算で見る酵素反応
量子化学計算を
※イメージ画像シミュレーションで見るタンパク質
分
※イメージ画像粗視化シミュレーションの開発
細胞の
※イメージ画像機械学習でタンパク質の機能を予測
機械学習などを
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4段階で、
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- トップの
画像:「Dynamic simulation screenshot」 Jih24/CC BY-SA 4.0(トリミング) - 量子化学計算で
見る酵素反応:「Active site of human ACE2」 ChemPro/CC0(トリミング) - シミュレーションで
見るタンパク質:「7CN1 viewed from outside」 Asai, T.,Adachi, N.,Moriya, T.,Kawasaki, M.,Suzuki, K.,Senda, T.,Murata, T./CC0(トリミング) - 粗視化シミュレーションの
開発:「All atom vs coarse grain DPPC bilayer」 Christopher Rowley/CC0(トリミング) - 機械学習で
タンパク質の 機能を 予測:「TMEM253 AlphaFold Predicted Structure」 Liu02511/CC0(トリミング) - 関連する
研究室 (生物化学研究室) :「House mouse (Mus musculus) 2732」 Ahunt/CC0(トリミング) - 関連する
研究室 (生命情報解析研究室) :「Heatmap」 Miguel Andrade at English Wikipedia/パブリックドメイン (トリミング) - 関連する
研究室 (細胞機能工学研究室) :「Streptomyces hygroscopicus」 Snuupo/CC BY-SA 4.0(トリミング) - 関連する
研究室 (植物機能工学研究室) :「Arabidopsis thaliana sl13」 Stefan.lefnaer/CC BY-SA 4.0(トリミング)
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