富井研究室（分子機能情報学講座・産業技術総合研究所）

Research研究课题

生体高分子の配列・構造・機能に関する多様で膨大なデータを使い、新しい生物学の知識を見つけるための解析手法の開発と、その応用に取り組んでいます。計算構造生物学と配列情報解析が中心ですが、国内外の大学・研究機関の計算と実験の研究者と共同で、幅広い分野の研究を行っています。

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タンパク質の立体構造を推定↗

アミノ酸の並びからタンパク質や複合体の立体構造を推定するため、似た配列を高い感度で探すプロファイル比較法FORTEを開発しています。深層学習でアミノ酸どうしの接触を予測する手法DeepECAも開発しています。

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基質結合部位を高速に比べる↗

立体構造からの機能予測や創薬への応用を目指し、基質が結合する部位を網羅的に比べる高速な手法を津田研究室と共同で開発しました。比較の結果はデータベースPoSSuMとして公開しています。

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配列解析の基礎技術↗

計算生物学の根幹であるアラインメントのために、アミノ酸置換行列MIQSを開発しました。多重配列アラインメントの計算法MAFFTなどの基礎技術も共同で開発し、京都大学の研究室と衛星画像から海の微生物を推定する手法にも取り組んでいます。

Voices学长学姐的评价

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