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生物情報工学研究室
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コンピュータでタンパク質がはたらくしくみを解き明かす研究室。
AboutAbout the lab
コンピュータでタンパク質を理解する。
生物情報工学研究室は、
バイオインフォマティクスや
酵素が
実験を
Key terms
- 量子化学計算
- 電子の
ふる まいを 量子力学にもと づいて 計算し、 分子の 性質や 化学反応の 起こり方を 調べる 方法 - 分
子動力学シミュレーション - 原子や
分子には たらく 力を 計算し、 その 動きを コンピュータの 中で 時間を 追って 再現する 方法 - 粗視化
- いく
つかの 原子を ひとつの 粒に まとめて 扱い、 計算を 軽くして 大きな 系や 長い 時間を 扱えるように する 工夫
NewsLab news
博士課程の
学生が、 第26回日本蛋白質科学会年会で ポスター賞を 受賞 学生が、
第5回生体分子シミュレーション・モデリング研究会で 学生優秀発表賞を 受賞 博士課程の
学生が、 第63回日本生物物理学会年会で 学生発表賞を 受賞 博士課程の
学生が、 第38回分子シミュレーション討論会で 学生優秀発表賞を 受賞
ResearchResearch themes
コンピュータを
*Illustrative image量子化学計算で見る酵素反応
量子化学計算を
*Illustrative imageシミュレーションで見るタンパク質
分
*Illustrative image粗視化シミュレーションの開発
細胞の
*Illustrative image機械学習でタンパク質の機能を予測
機械学習などを
MembersFaculty
生物情報工学研究室の
- Professor寺田 透Publications ↗
- Associate Professor佐藤 玄Publications ↗
- Project Assistant Professor根上 樹
VoicesStudent voices
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Students who take part in an interview may receive a thank-you gift worth ¥1,000, regardless of what they say.
On a 4-point scale, ● marks where students' answers fall
Who is this lab for?
What's great about this lab?
What did you learn after joining?
What's the vibe, and what is the professor like?
Where do graduates go?
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- Top image: “Dynamic simulation screenshot” Jih24 / CC BY-SA 4.0 (cropped)
- 量子化学計算で
見る酵素反応: “Active site of human ACE2” ChemPro / CC0 (cropped) - シミュレーションで
見るタンパク質: “7CN1 viewed from outside” Asai, T.,Adachi, N.,Moriya, T.,Kawasaki, M.,Suzuki, K.,Senda, T.,Murata, T. / CC0 (cropped) - 粗視化シミュレーションの
開発: “All atom vs coarse grain DPPC bilayer” Christopher Rowley / CC0 (cropped) - 機械学習で
タンパク質の 機能を 予測: “TMEM253 AlphaFold Predicted Structure” Liu02511 / CC0 (cropped) - Related lab (生物化学研究室): “House mouse (Mus musculus) 2732” Ahunt / CC0 (cropped)
- Related lab (生命情報解析研究室): “Heatmap” Miguel Andrade at English Wikipedia / Public domain (cropped)
- Related lab (細胞機能工学研究室): “Streptomyces hygroscopicus” Snuupo / CC BY-SA 4.0 (cropped)
- Related lab (植物機能工学研究室): “Arabidopsis thaliana sl13” Stefan.lefnaer / CC BY-SA 4.0 (cropped)
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