木賀研究室

About关于研究室

尝试创造曾有可能存在的生命。

木賀研究室以遗传工程的发展形态——合成生物学为手段开展研究。
合成生物学是一个以基因组信息等已积累的生物分子信息为基础，将DNA、RNA、蛋白质等生命的“零部件”组合起来，目标是在试管内或细胞内构建人工生命系统的领域。
研究范围涵盖从对生命起源的理学探究，到确立生物设计方法并将其应用于产业。
该研究室计划推进研究介绍中所列的工作，但这并非绝对的限制，教师写道，支持有志者带着自己独特的问题意识开展研究。

Research研究课题

该研究室以遗传工程的发展形态——合成生物学为手段，开展从生命起源的理学探究，到通过确立生物设计方法实现产业应用的研究。研究将通过实验制造分子的工作与利用AI设计序列和回路的工作结合起来推进。

※示意图

氨基酸种类发生变化的蛋白质的人工进化↗

生命为何使用现在的20种氨基酸，是关系到生命起源的根本性问题。研究使用经人工改造的遗传密码的翻译体系和人工细胞，制造氨基酸种类发生变化的蛋白质，并开展使其人工进化的实验。

※示意图

用AI设计蛋白质↗

即使是功能相同的蛋白质，数据库中也登记了大量因物种而略有差异的序列。研究以这些序列作为训练数据，用深度学习对序列空间建模，生成新的序列。再通过三维结构预测AI筛选有前景的候选序列，实际合成后用生物实验加以验证。

※示意图

自动生成与研究者构想相对应的人工基因回路↗

基因包含“制造什么”和“何时制造”两种信息，其中后者需要研究者来设计。以往由人类评估庞大的组合，现在引入AI，目标是根据研究者的构想自动生成调控系统。

※示意图

再现生命诞生的关键分子↗

研究再现RNA世界中存在的核酶等在生命诞生初期起关键作用的生物大分子，通过阐明其功能来接近生命的起源。同时也在推进探索生物分子在与地球不同的环境下如何表现的研究。

Voices学长学姐的评价

评价基于在读（或曾在读）学生的个人经历，不代表研究室官方观点。评价的有无或数量不代表对研究室的评价。

对于接受采访的学生，无论内容如何，我们可能会赠送谢礼（价值1,000日元的礼品）。