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计算生物物理学(原田 隆平)研究室
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该研究室通过计算揭示蛋白质等生物分子的运动。

About关于研究室
通过计算科学阐明生物分子的作用机制。
原田研究室以分
生物学类的许多研究室研究的对象涵盖从细胞到生态系统,
在生物学类中较为少见的是,
即使没有计算机或分子模拟方面的预备知识,
术语说明
- 分子动力学
- 计算大量原子之间的相互作用,
并以时 间序列数据的形式得到原子坐标的模拟方法 - 超级计算机
- 能够高速处理大规模计算的大型计算机。
使用的是计算科学研究中 心的设备 - 机器学习
- 让计算机从数据中学习规律的方法。
该研究室将其用于分子动力学时间序列数据的预测和分 析
Research研究课题
原田研究室以分
※示意图蛋白质折叠问题
蛋白质的形状几乎由氨基酸序列决定,
※示意图分子动力学与机器学习
将机器学习应用于通过分子动力学计算得到的原子坐标时间序列数据。
※示意图新计算方法的开发
与蛋白质功能相关的结构变化需要毫秒至秒级的长时间,
Members教师
原田研究室的成员由教师以及
- 副教授原田 隆平
Voices学长学姐的评价
评价基于在读
对于接受采访的学生,
学长学姐的评价
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学长学姐的评价会回答这些问题
- 这个研究室的推荐点是什么?
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千葉智樹研究室生命环境学群 生物学类【千叶 智树】专业领域:分子细胞生物学。
結構
生物多样性信息学本页信息由LabLog运营团队根据研究室的公开信息和采访整理。
关于图片
顶部和研究课题的图片为示意图,
- 顶部图片:《Anton supercomputer》 Matt Simmons/CC BY 2.0(裁剪)
- 蛋白质折叠问题:《Platform for protein crystallography and X-ray scattering》 Evgeny Pelevin/CC BY 4.0(裁剪)
- 分子动力学与机器学习:《Dutch national supercomputer "Huygens"》 Dennis van Zuijlekom/CC BY-SA 2.0(裁剪)
- 新计算方法的
开发:《The catalyst high performance computing (HPC)》 ENERGY.GOV/公有领域 (裁剪) - 相关研究室
(分子系统学 (稲垣 祐司) 研究室) :《Darwin tree》 Charles Darwin/公有领域 (裁剪) - 相关研究室
(千葉智樹研究室) :《Stain for SDS-PAGE gel》 Andra MIhali from New York City, United States/CC BY-SA 2.0(裁剪) - 相关研究室
(結構 生物学 (田中 俊之) 研究室) :《Using X-ray diffractometer to solve the 3D structure of membrane proteins of the flagellar system ( )》 OIST from Onna Village, Japan/CC BY 2.0(裁剪) - 相关研究室
(生物多样性信息学 (伊藤 希) 研究室) :《CSIRO ScienceImage 1332 Pinned Insect Specimens》 division, CSIRO/CC BY 3.0(裁剪)
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