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杉田研究室
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在计算机中再现生物分子的运动与功能的计算生物物理研究室。

About关于研究室
从分子到细胞,用计算理解生命。
杉田研究室结合物理、
其目标是在从分子到细胞的尺度上,
该研究室在量子化学、
所开发的方法已集成到分子动力学软件GENESIS中,
术语说明
- 分子动力学
- 用运动方程一步
一步地计算原子和分 子的运动, 在计算机中再现分子行为的方法 - 粗粒化
- 把若干个原子合并成一个粒子来处理,
从而能够对较大的体系进行长时间计算的方法 - 液-液相分离
- 就像水和油那样,
细胞内的分子浓集成液滴, 并与周围的液体分成两相的现象
News研究室公告
杉田教授等人的论文发表于The Journal of Physical Chemistry Letters
杉田教授等人的论文发表于Journal of Computational Chemistry
杉田教授等人共同获得2025年度理研荣峰奖
杉田教授等人的论文发表于Current Opinion in Structural Biology
研究团队的成果发表于Proc. Natl. Acad. Sci. USA
Research研究课题
目标是阐明细胞内众多生物分子是如何相互作用,
※示意图多尺度分子动力学
原子水平的分子动力学模拟所能计算的时间和
※示意图AI与机器学习
将机器学习与多尺度分子动力学相结合,
※示意图生物分子动力学
将分子动力学模拟用作“计算显微镜”,
※示意图细胞内的分子拥挤环境
细胞内挤满了无数的生物分子。
Members教师
杉田研究室
- 教授杉田 有治研究成果 ↗
- 助理教授ウガルテ ラ トレ ディエゴ
Voices学长学姐的评价
评价基于在读
对于接受采访的学生,
学长学姐的评价
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学长学姐的评价会回答这些问题
- 这个研究室的推荐点是什么?
- 进入后才知道的事情是什么?
- 氛围和老师的性格如何?
- 推荐给什么样的学生?
- 毕业后的去向?
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本页信息由LabLog运营团队根据研究室的公开信息和采访整理。
关于图片
顶部和研究课题的图片为示意图,
- 顶部图片:《Pleiades two row》 NASA Ames Research Center/公有领域
(裁剪) - 多尺度分子动力学:《RIKEN AICS》 J o/CC BY-SA 3.0(裁剪)
- AI与机器学习:《Artificial Neural Network with Chip》 mikemacmarketing / photo on flickr/CC BY 2.0(裁剪)
- 生物分子动力学:《Myoglobin-1mba》 Opabinia regalis/CC BY-SA 3.0(裁剪)
- 细胞内的分子拥挤环境:《E coli at 10000x, original》 Photo by Eric Erbe, digital colorization by Christopher Pooley, both of USDA, ARS, EMU./公有领域
(裁剪) - 相关研究室
(岡田研究室) :《Multicolor fluorescence image of a living HeLa cell》 8x57is/CC BY-SA 4.0(裁剪) - 相关研究室
(竹内研究室) :《B72Textur》 Minutemen/CC BY-SA 3.0(裁剪) - 相关研究室
(能瀬研究室) :《Drosophila larvae mariometzler》 Mario Metzler/CC BY 2.5(裁剪) - 相关研究室
(生物非平衡物理学研究室) :《Nematic liquid crystal》 Ingo Dierking/CC BY-SA 4.0(裁剪)
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