蛋白質デザイン研究室

About研究室について

タンパク質を計算機でゼロからデザインする。

蛋白質デザイン研究室は、物理化学とデータ科学にもとづいてタンパク質を計算機上でデザインし、その構造のでき方や機能が現れる原理を研究しています。
自然界のタンパク質は自然が何十億年をかけて創り上げた完成品で、それらを解析するだけでは動作のメカニズムを明らかにするのは困難だと考えています。
設計したタンパク質が実際にどう振る舞うのかを生化学実験で調べ、タンパク質設計技術の開発につなげています。
研究室は大阪大学蛋白質研究所の附属蛋白質先端データ科学研究センター（ASPiRE）にあり、サイトでは「古賀研究室」の名前でも紹介されています。

Research研究テーマ

タンパク質は、アミノ酸配列に従って決まった立体構造に折りたたまれ、機能を発揮します。この研究室は、物理化学とデータ科学にもとづく仮説からタンパク質を計算機上でデザインし、その振る舞いを生化学実験で調べて、構造のでき方や機能が現れる原理の解明と設計技術の開発を目指しています。

※イメージ画像

新規タンパク質のゼロからのデザイン↗

自然界のタンパク質データの解析や分子シミュレーション、生化学実験を使い、タンパク質を完全にゼロからデザインする手法を開発しています。二次構造やループの長さといった主鎖構造に着目し、様々な形のタンパク質を原子レベルの精度でデザインしてきました。

※イメージ画像

自然界のタンパク質の改造↗

ゼロからのデザインで開発した技術を使い、自然界のタンパク質を大きく改造して、安定性の向上や新しい機能の付与に挑んでいます。ポリエチレンテレフタレート分解酵素の耐熱化や、回転型分子モーターV1-ATPaseへの新規アロステリック部位の付与に成功しています。

Voices先輩の声

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