五斗研究室（ライフサイエンス統合データベース講座・国立遺伝学研究所）

About研究室について

生命のデータを、つないで活かす。

五斗研究室は、生命情報とその活用のための統合データベースを研究・開発しています。
ヒトをはじめ多くの生物のオミクスデータが大量に生まれ、それを扱うデータベースや、データの解釈を助けるしくみが重要になっています。
データベースの開発に加え、データベースを使って機能を推定する手法やツールの開発、文献からの知識の抽出支援にも取り組んでいます。
研究室はライフサイエンス統合データベースセンター（DBCLS）にあり、学生も主にここで研究します。

Research研究テーマ

オミクスデータとその機能情報を統合したデータベースと、それを使って機能情報を推定する手法・ツールを開発しています。実問題への応用や、データベースの基盤となる知識の抽出支援にも、あわせて取り組んでいます。

※イメージ画像

知識グラフによるデータベース統合↗

世界中に散らばるデータベースを、RDFという共通の枠組みで意味づけし、つながった巨大なグラフ（知識グラフ）として扱います。知識グラフを作る方法や、そこから効率よくデータを取り出す基盤技術を開発しています。

※イメージ画像

オミクスデータから機能を予測↗

実験系の研究者と共同で、ゲノムやメタゲノムから機能を評価する枠組みを作っています。文献やデータベースから集めた微生物の生育環境の情報を知識ベース化し、培養条件の予測などへの応用を試みています。

※イメージ画像

テキストマイニングの開発↗

データベースに無く、文献の中にしかない知識を使えるように、文献処理の技術を研究開発してきました。遺伝子機能の推定などに使える基盤に向けて、文献に含まれる知識のRDF化を支援する研究を進めています。

Voices先輩の声

評価・クチコミは、在籍している（していた）学生個人の経験に基づくもので、研究室の公式見解ではありません。クチコミの有無や件数は、研究室の評価を表すものではありません。

インタビューに協力いただいた学生に、内容にかかわらず謝礼（1,000円分のギフト）をお渡しすることがあります。