檜垣研究室

About研究室について

境界に立ち、生命を見つめる。

檜垣研究室は、植物の細胞の中で構造が秩序よく整うしくみと、環境の変化への応答を研究しています。
生きた細胞を顕微鏡で撮り続けるライブセルイメージングと、画像を数値にする画像解析が研究の土台です。
生命科学に限らず、情報科学や数理科学など異なる分野の考え方や方法も取り入れる「学融合」を大切にしています。

Research研究テーマ

細胞の中にある秩序だった構造と、光などの環境の変化への柔軟な応答が、どう両立しているのかの理解を目指しています。植物細胞を対象に、ライブセルイメージングと画像解析を基盤に研究を進めています。

※イメージ画像

植物細胞のかたちづくり↗

細胞骨格やオルガネラを生きた細胞の中で見えるようにし、構造や動きを画像解析で数値にします。変化していく細胞の中を観て測り、秩序が生まれるしくみを探ります。

※イメージ画像

環境に応じて動く気孔↗

植物の表面にある気孔は、複数の細胞が協調して開いたり閉じたりします。ライブセルイメージングや分子・細胞生物学の手法で、細胞骨格や膜交通、細胞どうしの協調の面からしくみを調べます。

※イメージ画像

顕微鏡画像から特徴を自動で見つける↗

ImageJ/FijiやPythonによる解析、必要に応じて機械学習も使い、大量の細胞画像から特徴や状態の変化を取り出します。「画像を見る」ことを、再現性のある定量データに変える研究です。

※イメージ画像

細胞の自己組織化を実験と数理で↗

ライブイメージングで得た実データに、定量解析やシミュレーションを組み合わせ、細胞の中に特徴的なパターンが生まれる原理を考えます。

Voices先輩の声

評価・クチコミは、在籍している（していた）学生個人の経験に基づくもので、研究室の公式見解ではありません。クチコミの有無や件数は、研究室の評価を表すものではありません。

インタビューに協力いただいた学生に、内容にかかわらず謝礼（1,000円分のギフト）をお渡しすることがあります。