土原研究室

About研究室について

臨床とデータをつなぎ、がん克服へ。

土原研究室は、国立がん研究センターに集まる臨床の情報と大量の解析データを組み合わせて、がんを研究しています。
患者さんの検体や細胞のモデルから得たゲノムやトランスクリプトーム、マイクロバイオームなどのデータを統合し、新しい知識を引き出します。
そのために、データ処理のパイプラインの設計やデータベースの構築など、バイオインフォマティクスの技術を使っています。

Research研究テーマ

がんの治療開発には、質の担保された臨床情報と、患者検体などを使った多層オミクス解析のデータが欠かせません。国立がん研究センターに集まるこうしたデータを最大限に生かし、がんの克服に向けた新しい発見を目指しています。

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選択的プロモーターの分類と成り立ち↗

1つの遺伝子が複数の場所から読み出される現象を、選択的プロモーターと呼びます。ゲノム全体から網羅的に抜き出し、ヒストン修飾やメチル化、薬の効き方などのデータと組み合わせて、その意義としくみを調べています。

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日本人のCHIPの検出と解析↗

血液のがんでよくみられる遺伝子変異をもつ細胞の集団は、健康な人の血液からも見つかり、CHIPと呼ばれます。日本人のデータベースを使ってその特徴を明らかにし、病気につながるものとの見分け方を探っています。

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がんの種類をまたいだ腸内細菌叢の解析↗

産学協同のがん種横断研究プロジェクトで集めた腸内細菌叢のデータを、臨床情報やがんのゲノム情報と組み合わせます。多くの種類のがんで、病気の状態や治療の効果と腸内細菌叢との関係を明らかにしようとしています。

Voices先輩の声

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